11. – 14. června 2012
Program
Počet registrovaných účastníků: 65, Počet přednášek: 50, Počet posterů: 14
pondělí, 11. červen
| Přivítání |
| 16:45 |
Úvodní slovo - Daniel Svozil, VŠCHT v Praze, Praha
|
|
| Mírně vzdělávací přednášky. |
Chairman: Ondřej Uhlík, VŠCHT v Praze, Praha |
| 17:00 |
Co je chemoinformatika?
Daniel Svozil, VŠCHT v Praze, Praha
|
| 17:20 |
ChemGenDB – integrovaná platforma pro sběr a analýzu chemických sloučenin a HTS dat
Jindřich Jindřich, Ústav molekulární genetiky AV ČR, Praha
|
| 17:40 |
Snížení dimenze molekulární struktury
Vojtěch Spiwok, VŠCHT v Praze, Praha
|
| 18:10 |
Konec přednáškového bloku
|
|
| Večeře - 19:00 |
Servírovaná v hotelové restauraci. |
úterý, 12. červen
| Bio a chemoinformatická infrastruktura v České republice a její zapojení do evropského prostoru. |
Chairman: Petr Bartůněk, Ústav molekulární genetiky AV ČR, Praha |
| 09:00 |
CZ-OPENSCREEN: Národní infrastruktura chemické biologie
Petr Bartůněk, Ústav molekulární genetiky AV ČR, Praha
|
| 09:20 |
Evropská bioinformatická infrastruktura ELIXIR
Jiří Vohradský, Mikrobiologický ústav AV ČR, Praha
|
| 09:40 |
CZ_ELIXIR – infrastruktura pro biologická data v ČR, současný stav a perspektiva.
Jiří Vondrášek, Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, Praha
|
| 10:00 |
FOBIA
Jan Pačes, Ústav molekulární genetiky AV ČR, Praha
|
| 10:20 |
Coffee break
|
| 10:50 |
IT4Innovations
Václav Snášel, VŠB-Technická universita Ostrava, Ostrava
|
| 11:10 |
ESFRI-ISBE: Infrastruktura pro systémovou biologii v Evropě
Rudiger Ettrich, Ústav nanobiologie a strukturní biologie AV ČR, Nové Hrady
|
| 11:30 |
Instruct – evropská infrastruktura pro integrativní strukturní biologii
Jan Dohnálek, Ústav makromolekulární chemie AV ČR, Praha
|
| 11:50 |
CEITEC a jeho bioinformatická infrastruktura
Radka Svobodová Vařeková, CEITEC MU - Středoevropský technologický institut, Brno
|
|
| Oběd - 12:10 |
Servírovaný v hotelové restauraci. |
| Představení vědeckých skupin |
Chairman: Bohdan Schneider, Ústav biotechnologie AV ČR, Praha |
| 14:00 |
Chemoinformatický tým, CEITEC MU
Radka Svobodová Vařeková, CEITEC MU - Středoevropský technologický institut, Brno
|
| 14:20 |
Bioinformatika na KSI MFF UK
David Hoksza, MFF UK, Praha
|
| 14:40 |
Laboratoř molekulárního rozpoznávání na Biotechnologickém ústavu AV ČR
Bohdan Schneider, Ústav biotechnologie AV ČR, Praha
|
| 15:00 |
Bioinformatický a chemoinformatický výzkum v Loschmidtových laboratořích
Jan Brezovský, Masarykova univerzita, Přirodovědecká fakulta, Brno
|
| 15:20 |
Oddělení struktury a funkce proteinů Ústavu nanobiologie a strukturní biologie na Nových Hradech
Rudiger Ettrich, Ústav nanobiologie a strukturní biologie AV ČR, Nové Hrady
|
| 15:40 |
Coffee break
|
| 16:10 |
Pražský stringologický klub a bioinformatika
Jan Holub, ČVUT FIT, Praha
|
| 16:30 |
Buněčný osud a informatika
Petr Bartůněk, Ústav molekulární genetiky AV ČR, Praha
|
| 16:50 |
Skupina genomiky a bioinformatiky na ÚMG
Jan Pačes, Ústav molekulární genetiky AV ČR, Praha
|
| 17:10 |
Výzkumná skupina bioinformatiky ve spolupráci FI MU a FIT VUT v Brně
Tomáš Martínek, Vysoké učení technické v Brně, Fakulta informačních technologií, Brno
|
| 17:30 |
Strukturní bioinformatika na katedře fyzikální chemie UP v Olomouci
Karel Berka, Katedra fyzikální chemie, Univerzita Palackého v Olomouci, Olomouc
|
| 17:50 |
IT4 Knowledge management
Václav Snášel, VŠB-Technická universita Ostrava, Ostrava
|
| 18:10 |
Konec přednáškového bloku
|
|
| Poster session - 19:00 |
Cena pro nejlepší poster je věnována Středoevropským technologickým institutem Ceitec.
Poster session bude oživena obloženými mísami, pivem a vínem.
 seznam příspěvků
|
středa, 13. červen
| Studium bioinformatiky a chemoinformatiky na českých vysokých školách. |
Chairman: Eva Chovancová, Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, Brno |
| 09:00 |
Projekt BIOMEDREG a EATRIS jako infrastruktura pro molekulární a translační medicínu
Marián Hajdúch, Ústav molekulární a translační medicíny LF UP a FN Olomouc, Olomouc
|
| 09:20 |
Bakalářský a magisterský obor na VŠCHT v Praze kombinující přírodovědné a informatické vzdělání.
Daniel Svozil, VŠCHT v Praze, Praha
|
| 09:40 |
Chemoinformatika a bioinformatika - bakalářský studijní obor MU
Radka Svobodová Vařeková, CEITEC MU - Středoevropský technologický institut, Brno
|
| 10:00 |
Výuka bioinformatiky pro studenty biologických oborů na Masarykově univerzitě
Eva Chovancová, Masarykova univerzita, Přírodovědecká fakulta, Brno
|
| 10:20 |
Coffee break
|
| 10:50 |
Studium bioinformatiky a systémové biologie na FI MU
Matej Lexa, Masarykova Univerzita, Fakulta informatiky, Brno
|
| 11:10 |
Obor Bioinformatika a biocomputing na FIT VUT v Brně
Tomáš Martínek, Vysoké učení technické v Brně, Fakulta informačních technologií, Brno
|
| 11:30 |
Výuka bioinformatických předmětů na Ústavu biomedicínského inženýrství VUT v Brně
Helena Škutková, Fakulta elektrotechniky a komunikačních technologií, VUT Brno, Brno
|
| 11:50 |
Bioinformatika v praxi – výuka předmětu na pomezí informatických a biologických věd
Josef Houser, CEITEC MU - Středoevropský technologický institut, Brno
|
|
| Oběd - 12:10 |
Servírovaný v hotelové restauraci. |
| Prezentace vědeckých projektů. |
Chairman: Jan Holub, Fakulta informačních technologií, ČVUT, Praha |
| 14:00 |
Cytochromy P450 - metabolismus léčiv z pohledu strukturní bioinformatiky
Karel Berka, Katedra fyzikální chemie, Univerzita Palackého v Olomouci, Olomouc
|
| 14:20 |
Bioinformatika a analýza dat v biomedicínském výzkumu - přehled projektů a zkušeností v rámci projektu BIOMEDREG
Lenka Radová, Ústav molekulární a translační medicíny LF UP a FN Olomouc, Olomouc
|
| 14:40 |
Netradiční výpočetní metody v problémech interdisciplinární informatiky
Ivan Zelinka, VŠB-TU Ostrava, Ostrava
|
| 15:00 |
Instant JChem
Petr Hamerník, ChemAxon, s.r.o., Praha
|
| 15:20 |
Molpher – algoritmus pro exploraci chemického prostoru
David Hoksza, MFF UK, Praha
|
| 15:40 |
Coffee break
|
| 16:10 |
Predikce pKa pro nově navržené molekuly léků
Stanislav Geidl, CEITEC MU - Středoevropský technologický institut, Brno
|
| 16:30 |
Portál chemické biologie a medicinální chemie a (chemo)informatický model zpracování dat v uHTS/HCA platformě.
Petr Džubák, Ústav molekulární a translační medicíny, Lékařská fakulta UP v Olomouci, Olomouc
|
| 16:50 |
GraphAlignment: Bayesovské párové porovnávání biologických sítí
Michal Kolář, Ústav molekulární genetiky AV ČR, Praha
|
| 17:10 |
Tyrosinová fosforylace v SH3 doménách – pozice, funkce a evoluce
Marian Novotný, PřF UK, Praha
|
| 17:30 |
Podobnostní vyhledávání v databázích proteinových struktur
Jakub Galgonek, MFF UK, Praha
|
| 17:50 |
Populační historie virů způsobující vzteklinu
Jiří Moravec, Institut biostatistiky a analýz Lékařské a Přírodovědecké fakulty Masarykovy univerzity, Brno
|
| 18:10 |
Konec přednáškového bloku
|
|
| Grilování - 19:00 |
Na zahradě před hotelem se bude grilovat krůta a jiné pochutiny. K jídlu se bude podávat jak víno, tak především pivo. Z piv je pro vás nachystáno: Žatec světlý 12°, Černá Hora Granát Tmavé 12°, Primátor pšeničné, Kocour višňový ležák 12° a Kocour V3 Rauchbier 14°. |
čtvrtek, 14. červen
| Prezentace vědeckých projektů. |
Chairman: Michal Kolář, Ústav molekulární genetiky AV ČR, Praha |
| 09:00 |
Bioinformatická analýza struktur rozhraní interagujících proteinů a DNA
Bohdan Schneider, Ústav biotechnologie AV ČR, Praha
|
| 09:20 |
Nástroje společnosti Elsevier pro chemoinformatiku a bioinformatiku
Jiří Jirát, VŠCHT v Praze, Praha
|
| 09:40 |
Diverzita genů bphA v kontaminované zemině a zahradnickém substrátu.
Michal Strejček, VŠCHT v Praze, Praha
|
| 10:00 |
Evoluční historie organismů na základě divergence DNA sekvencí
Natália Martínková, Ústav biologie obratlovců AV ČR, Brno
|
| 10:20 |
Coffee break
|
| 10:50 |
Bakteriální inženýrství, aneb umějí bakterie počítat?
Petr Sosík, Slezská univerzita v Opavě, Opava
|
| 11:10 |
Přístupy k predikci interakce proteinů a DNA pomocí strojového učení
Andrea Szaboová, ČVUT v Praze, Praha
|
| 11:30 |
SiteBinder – softwarový nástroj pro porovnávání velkého počtu strukturních motivů proteinů
David Sehnal, CEITEC MU - Středoevropský technologický institut, Brno
|
| 11:50 |
Využití bioinformatických nástrojů pro studium vlivu přírodních látek na složení bakteriálních společenstev v zemině kontaminované polychlorovanými bifenyly
Lucie Musilová, VŠCHT v Praze, Praha
|
|
| Oběd - 12:10 |
Servírovaný v hotelové restauraci. |
